El Programa de residencia pediátrica de St. Josepth's ofrece una variada y sofisticada experiencia para los médicos que desean ser pediatras. El Centro de Salud Infantil ofrece un plan de estudios de vanguardia que hace énfasis en pediatría general, con cambios innovadores en los aspectos psicológicos de la atención primaria de pediatría. El programa de tres años brinda una base sólida ya sea para ofrecer consultas sobre atención primaria o para capacitación adicional en subespecialidades pediátricas. Los residentes de pediatría tienen la oportunidad de adquirir experiencia en el Centro de Atención Pediátrica Ambulatoria (PACC).  Para finales de junio del 2006, el Programa de residencia pediátrica contará con 10 médicos residentes en cada año de entrenamiento, 30 en total.

Las áreas de especialidades médicas en pediatría de St. Joseph's incluyen: pediatría general, pediatría para la conducta y el desarrollo, evaluación de abuso infantil, neurología pediátrica, nefrología, cirugía cardiovascular, neumología, genética, gastroenterología y medicina del adolescente.